Wśród międzynarodowych rankingów porównujących pozycję uczelni w poszczególnych dyscyplinach naukowych szczególne znaczenie mają globalny ranking dyscyplin akademickich, tzw. ranking szanghajski, oraz światowy ranking uniwersytetów QS według dyscyplin.
W najnowszej edycji rankingu szanghajskiego z 2026 roku, w dyscyplinie matematyka, obejmującej 500 sklasyfikowanych instytucji, Uniwersytet Jagielloński znalazł się w przedziale 151–200, poprawiając wynik z edycji 2025, w której zajmował miejsce w przedziale 201–300. Jest to obecnie najlepszy wynik wśród polskich uczelni, osiągnięty ex aequo z Akademią Górniczo-Hutniczą w Krakowie. Uniwersytet Warszawski oraz Uniwersytet Wrocławski zostały sklasyfikowane w przedziale 201–300.
W światowym rankingu uniwersytetów QS według dyscyplin 2026 w zakresie matematyki Uniwersytet Jagielloński zajmuje miejsce w przedziale 301–350. Wyżej spośród polskich uczelni sklasyfikowano Uniwersytet Warszawski, zajmujący miejsce w przedziale 151–200, oraz Politechnikę Warszawską, sklasyfikowaną w przedziale 251–300. W tym samym przedziale co Uniwersytet Jagielloński znalazły się Akademia Górniczo-Hutnicza oraz Politechnika Wrocławska. Oznacza to, że UJ zajmuje ex aequo 3.–5. miejsce w Polsce.
Światowym liderem rankingu QS w matematyce pozostaje od kilku lat Massachusetts Institute of Technology (MIT), który zajmuje pierwsze miejsce również w edycji 2026. W rankingu szanghajskim pierwszą pozycję w matematyce w edycji 2026 zajmuje natomiast Uniwersytet Princeton, przed Uniwersytetem Paris-Saclay oraz Uniwersytetem Oksfordzkim. Uniwersytet Princeton zajmował pierwsze miejsce również w latach 2017–2019 oraz 2023–2025, natomiast w latach 2020–2022 liderem był Uniwersytet Paris-Saclay.
Wśród krajowych rankingów uwzględniających zarówno potencjał naukowy, jak i dydaktyczny, na szczególną uwagę zasługuje ranking kierunków studiów „Perspektywy”, przygotowywany przez Fundację Edukacyjną „Perspektywy”. W edycji 2026 dwa kluczowe kierunki studiów prowadzone na Wydziale Matematyki i Informatyki Uniwersytetu Jagiellońskiego zajmują miejsca w ścisłej krajowej czołówce: matematyka – 3. miejsce ex aequo z Politechniką Wrocławską, natomiast informatyka – 2. miejsce w Polsce, za Uniwersytetem Warszawskim.