Klasy pod patronatem Wydziału powstały w dwóch liceach w Krakowie.
I Liceum Ogólnokształcące im. Bartłomieja Nowodworskiego
W I Liceum Ogólnokształcącym im. Bartłomieja Nowodworskiego Katedra Matematyki Obliczeniowej Instytutu Informatyki i Matematyki Komputerowej od roku 2015 patronuje
klasie o profilu „matematyka komputerowa”. Pracownicy katedry prowadzą zajęcia z szeroko rozumianej matematyki komputerowej, na których uczniowie mają możliwość poszerzenia swojej wiedzy z zakresu matematyki i informatyki. Realizując między innymi projekty związane z topologiczną analizą danych, uczniowie mogą zobaczyć, jakie efekty przynosi łączenie metod tych dwóch dziedzin nauki.
V Liceum Ogólnokształcące im. Augusta Witkowskiego
Natomiast opiekę nad uczniami V Liceum Ogólnokształcącego im. Augusta Witkowskiego sprawuje Instytut Informatyki Analitycznej wraz z Instytutem Matematyki.
Klasa o profilu matematyczno-fizycznym przygotowuje do studiów informatycznych, na kierunkach ścisłych oraz technicznych. Od klasy pierwszej w programie znajdują się zajęcia z algorytmiki prowadzone przez pracowników Instytutu Informatyki Analitycznej. Program wzbogacony jest o fakultet matematyczny, nad którym czuwają pracownicy i doktoranci Instytutu Matematyki.